Na lista das igrejas situadas no território de Entre Lima e Minho, elaborada por ocasião das Inquirições de D. Afonso III, em 1258, Santa Maria de Paredes de Coura é citada como sendo uma das igrejas pertencentes ao bispado de Tui. Neste documento, cujo original se encontra na Torre do Tombo, denomina-se "Sancta Marina de Paredes". Figura no catálogo das mesmas igrejas, que o rei D. Dinis mandou organizar em 1320 para determinação da taxa a pagar, denominando-se "Sancte Marie de Paredes". Fazia parte do arcediagado de Cerveira. Em 1444, D. João I conseguiu do Papa que este território fosse desmembrado do bispado de Tui, passando a pertencer ao de Ceuta, onde se manteve até 1512. Neste ano, o arcebispo de Braga, D. Diogo de Sousa, deu a D. Henrique, bispo de Ceuta, a comarca eclesiástica de Olivença, recebendo em troca a de Valença do Minho. Em 1513, o Papa Leão X aprovou a permuta. Em 1546, no Memorial de Rui Fagundes, feito no tempo de D. Manuel de Sousa, aparece enquadrada na Terra de Coura. Na cópia de 1580 do Censual de D. Frei Baltasar Limpo sobre a situação canónica destes benefícios, refere-se que o direito de apresentação da metade sem cura desta igreja era do arcebispo e o da outra, com cura, de leigos. Segundo Américo Costa, esta igreja foi abadia da apresentação dos viscondes de Vila Nova de Cerveira. Em termos administrativos, há a referir que, em 1755, esta freguesia pertenceu à comarca de Viana do Castelo, em 1839à de Valença, e, em 1852, a Monção. Em 1878, finalmente, passou a pertencer a Paredes de Coura. Pertence à Diocese de Viana do Castelo desde 3 de Novembro de 1977.