El muro con apenas los restos de dos ventanas geminadas poco dicen de lo que fue el palacio real que, junto a Santa Clara, levantó la reina Isabel para poder visitar fácilmente su fundación. El palacio estaba ya construido en 1322, y a él se retirará la reina una vez fallecido su marido, don Dinís, en 1325. Doña Isabel donó el palacio a Santa Clara con la condición de que en él pudiesen alojarse los reyes de Portugal y su familia, aunque siempre con permiso de la abadesa. Fue en este palacio donde, el 7 de enero de 1355, fue asesinada doña Inés de Castro, amante del príncipe don Pedro, por orden del padre de éste –e hijo de doña Isabel y don Dinís–, Alfonso IV. El palacio será usado, aunque menos frecuentemente, por la familia real en el siglo XV. En 1429 salió de él la infanta doña Leonor de Aragón para casarse, en Santa Clara, con don Duarte de Portugal, y en él se refugió doña Isabel de Urgel en 1450, tras la muerte de su marido, el infante don Pedro, duque de Coímbra, en Alfarrobeira. Desde entonces el palacio fue abandonado y cae progresivamente en ruina, sancionándola la crecida del Mondego de 1559. A finales del XVI su solar está aforado como huerta.